Microsoft heeft de krasproblemen waarmee de Limited Edition van Halo 3 te kampen heeft, toegegeven. Een te lage houder die het schijfje op zijn plaats zou moeten houden, is de oorzaak van het probleem volgens Microsoft. Hierdoor kan de disc tijdens transport los schieten en heeft deze vrij spel in de doos, met alle gevolgen van dien.
Normaal gesproken vervangt Microsoft de bekraste games voor een kleine vergoeding, maar omdat het hier om Halo 3 gaat en de game zó ongelooflijk aanwezig is in het nieuws, wil men natuurlijk geen negatieve publiciteit op zich afroepen. Daarom is het vervangen van jouw bekraste Limited Edition Halo 3-game tot en met 31 december 2007 helemaal gratis. Hiervoor moet je naar een website gaan, het formulier downloaden, printen, invullen en opsturen. Binnen twee weken zou je dan een spiegelgladde Halo 3-disc opgestuurd moeten krijgen.